電子顯微鏡設備在實驗室中進行分析，能夠對樣品分析物，進行物性元素等方面的分析，哪怕是電氣分析也可以在樣品獲取數據的過程中，這些軟件的加入讓功能變得更加的強大。并且這種設備的選擇很多針對性也不一樣，不一樣的顯微鏡設備在進行研究分析的時候，選用方式還不同。 

Cryo-EM實際上也是一種電子顯微鏡，不過作為一種透射電鏡，在低溫的環境中能夠讓樣品持續維持低溫，并且在樣品處理技術中，使用比較簡單，能夠收集更高質量的數據的同時，確保樣品在低溫的環境中能夠維持更長的時間，這種維持更長的時間能夠讓研究人員獲得更全面的數據。 

電子顯微鏡設備在選擇的時候有些是透射電子顯微鏡，尤其是臺式掃描顯微鏡這些不一樣的選擇，在樣品分析的是一定要做出實際判斷只有選擇更合適的顯微鏡，才可以在分析的時候獲得更好的效果。不同的電子顯微鏡，有些智能化程度很高，操作更加智能，這些產品的使用所帶來的優勢，能夠獲得更好的作用。 

在分析研究中，分析觀察設備非常重要，Cryo-EM的使用也是為了能夠針對性進行研究，像一些蛋白質一樣的復合物采用的一種設備，這種傳統的顯微鏡根本不具備冷凍的效果，畢竟蛋白質復雜性比較不同，為了能夠更好地去檢驗這些蛋白質，采用冷凍的一種方式對樣品可以進行冷凍的研究，能夠獲得更準確的數據，在傳染病或者是疾病方面能夠帶來更好的突破，可以獲得更好的數據。這種電子顯微鏡的使用也是為了能夠確保樣品在冷凍的環境中保持穩定性，給工作人員更多的時間便于研究分析。